Melting of genomic DNA: Predictive modeling by nonlinear lattice dynamics

δείτε την πρωτότυπη σελίδα τεκμηρίου
στον ιστότοπο του αποθετηρίου του φορέα για περισσότερες πληροφορίες και για να δείτε όλα τα ψηφιακά αρχεία του τεκμηρίου*



Melting of genomic DNA: Predictive modeling by nonlinear lattice dynamics

The melting behavior of long, heterogeneous DNA chains is examined within the framework of the nonlinear lattice dynamics based Peyrard-Bishop-Dauxois (PBD) model. Data for the pBR322 plasmid and the complete T7 phage have been used to obtain model fits and determine parameter dependence on salt content. Melting curves predicted for the complete fd phage and the Y1 and Y2 fragments of the phi X174 phage without any adjustable parameters are in good agreement with experiment. The calculated probabilities for single base-pair opening are consistent with values obtained from imino proton exchange experiments.



Αγγλική γλώσσα

2012-10-01
2010-08-06
2012-10-01T15:28:49Z

DOI: http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevE.82.021905
http://hdl.handle.net/10442/12748


Ινστιτούτο Θεωρητικής και Φυσικής Χημείας (ΙΘΦΧ)
Τύποι Τεκμηρίων
Άρθρο σε περιοδικό
Συλλογές του Ήλιος




*Η εύρυθμη και αδιάλειπτη λειτουργία των διαδικτυακών διευθύνσεων των συλλογών (ψηφιακό αρχείο, καρτέλα τεκμηρίου στο αποθετήριο) είναι αποκλειστική ευθύνη των αντίστοιχων Φορέων περιεχομένου.